蛇叔少年时皮肤就非常苍白，带着青蓝色的勾玉状耳环。给人寒冷阴险的感觉，蛇叔的童年也不是很平坦，自幼父母双亡，六岁毕业于忍者学校后，与自来也、纲手一同成为猿飞日斩班的成员。他被第三代火影评为“是个才华洋溢的少年，数十年才出现一个的天才”，因此三代很器重蛇叔，这让年少时的自来也对其产生嫉妒之意，认为“老师心中只有大蛇丸一个”。因此在年幼时，他跟自来也的关系一直处于互相支持，同时也互相竞争的状态。
第二次忍界大战中，大蛇丸和自来也、纲手获得了“木叶三忍”的称号。蛇叔当过御手洗红豆的老师，也曾经一度被认为是第三代火影的继承者。因为看到了父母及同伴一个个的死亡，本身善良的大蛇丸感觉受到了生命的脆弱，感觉到人生的短暂，而大蛇丸本身热爱研究术，所以便潜心研究不老不死之术以及复活亡者的术。并掳走村中忍者作为实验对象。最后被三代发现逃离木叶。
蛇叔在叛逃后加入了 晓 成为了嫦娥计划的一员他在组织里是"空，但是蛇叔加入晓的目的只是为了方便他完成心愿，蛇叔看上了宇智波家族的能力，欲夺取宇智波鼬的身体,因为他看上了鼬的写出轮眼,想据为已有,但是鼬神吧，火迷们也懂实力太强了,蛇叔根本就拿不下鼬,所以他觉得心愿无望退出了组织。
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