2009年度的辽宁省男子乙组比赛中，周琦从12支队伍的各路篮球尖子中脱颖而出，开始受到关注。
2011年入选U16国少；2月12日，随国家队参加土耳其U16男篮国际邀请赛，周琦在与德国队的半决赛中狂砍41分28篮板15次封盖的大号三双数据，帮助中国队94-90击败德国闯入决赛，周琦凭借令人震撼的数据一战成名；决赛得到30分17个篮板8次封盖，中国队67-66险胜东道主土耳其夺得冠军，这是中国男篮任意年龄段首次在亚洲外的国际大赛上夺冠，他也因此被球迷称赞为“大魔王”；10月18日，随中国国青队出征在越南举行的第二届U16亚青赛，在决赛中，周琦砍下43分19个篮板12次封盖3次助攻，帮助中国队以92比52大胜韩国国青夺得本届亚青赛冠军。
