太平天国的坍塌与他们的内部斗争逃脱不了关系，比如说洪秀全和冯云山都是广东人，为何会跑去广西发动革命呢?这主要还是因为广西经济、文化落后，较邻省广东的差距巨大，人也比较的单纯，容易被洪秀全和冯云山的这套把戏糊弄。在当时的紫荆山根据地，洪秀全和冯云山是外来的，杨秀清和萧朝贵则是广西本地的，洪冯二人想发动革命，必须依赖当地人的势力，双方可谓说是一拍即合：洪秀全和冯云山有宗教上的号召力，而杨秀清和萧朝贵则能力聚集群众、有实力。
天父天兄下凡事件发生之前，洪秀全和冯云山享有全部的神权，足以号召那种人;但发生之后，神权已为双方所共有，杨秀清和萧朝贵实力大增，洪秀全和冯云山必须作出让步。只有这样，双方才有合作的基础。从金田起义到永安建制，双方一直保持的平衡，也是冯云山精心设计的结果，这从双方的位次可以看得出来，一、宗教位次：洪秀全(天父第二子)、冯云山(天父第三子)、杨秀清(天父第四子)、萧朝贵(天父女婿);政治位次：洪秀全(天王)、杨秀清(东王)、萧朝贵(西王)、冯云山(南王)。
冯云山可以说是太平天国初期最富有远见卓识的人，他能够“谋立创国”，自然会考虑到神权、君权、相权和兵权这四大权力分配的问题。但力求双方保持平衡更是当务之急，不取得暂时的平衡，太平天国连立足都难以维持，更谈不上发动起义了。因此他也不得不把精力首先放在保持平衡上。至于四大权力的合理分配，固然十分的重要，但可以在日后想办法补救。但后来局势的发展已经难以控制，四大权力的交叉越来越复杂，越来越难以控制，就算是冯云山不早死，恐怕也是没有办法力挽狂澜的。
这四大权力中，首先出现交叉的是神权。作为教主，洪秀全本应该完全掌握神权，这是不容有争议的。可是在此过程中，发生了杨秀清和萧朝贵分别代天父和天兄立言的“奇迹”。这样神权的交叉即出现了，即是洪秀全、杨秀清和萧朝贵三人共掌神权。平时，洪秀全是教主，高于杨秀清和萧朝贵。
但天父下凡的时候，杨秀清高于洪秀全和萧朝贵;天兄下凡的时候，萧朝贵又高于洪秀全和杨秀清。三人分掌神权，上下尊卑随时变化，十分的复杂。萧朝贵战死之后，也就只剩下了天父代言，交叉关系似乎简单化了，其实这反而促成了洪秀全和杨秀清之间的矛盾激化。后遗症不仅难以挽回，而是症状是越来越严重了。这说明太平天国建国之初的基础就非常的不牢靠。
再说兵权。金田起义之初，不管实力掌握在谁的手里，起码从形式上来看，还是洪秀全自掌兵符。1851年，洪秀全在茶地发布《行营铺排诏》，规定了前、后、左、右、中五军主将的职权，仍由洪秀全本人发号施令。而《天命诏旨书》却加上了这样的附注：“此是前时行营铺排如是，今宣听东王将令。”
也即是说，已经将兵权正式授予杨秀清了。为什么会作出这样的决定，只能是两个原因：一是洪秀全自知军事才能远不如杨秀清，自愿交出兵权;二是实力掌握在杨秀清手里，洪秀全指挥不动。二者必居其一，或者兼而有之。兵权是洪秀全公开授予杨秀清的。从此以后直到天京内讧为止，杨秀清独揽兵权。而在正统的皇权社会中，手握兵权的大将在战略问题上还是得请求君主的，不能自擅。所谓的“将在外，君命有所不受”，那也是特殊情况，偶尔为之。而杨秀清此后指挥作战，一切都是自己作主，想起来奏报就奏报，想不起来就不奏报，成了“将在内，君命就不想受”了。这样就形成了兵权侵犯君权的现象了。
再说相权。正统皇权社会中，皇帝尊重相权，给大臣一定的权限，让其独立工作，这比一切事情都由自己处理要好得多。大致的分工是这样的：皇帝是国家元首，是“权”的主体;宰相是政府首脑，是“能”的班子的负责人。处理日常政务，由宰相执行，对皇帝负责。著名的太平天国史专家罗尔纲先生认为太平天国是“军事负责制”，军事即相当于宰相。前期军师虽有四人，但是实权只在杨秀清手里，其他三人挂名而已。
永安建制的时候，国家已粗具规模，就有把相权与兵权分开的必要了。此时，洪秀全在《永安封王诏》中说“以上所封各王(西王、南王、北王、翼王)，俱受东王节制”，正式将太平天国的相权交给了杨秀清手里。皇权社会的宰相虽然有一定的权利，但也只能以皇帝的名义管治臣民，不能以自己的名义管治。而太平天国“传檄天下”之时，竟以军事的名义发布，而不是以天王的名义发布。定都天京以后，杨秀清又常以自己的名义发布文书，管治臣民。这样就造成了相权侵犯君权，相权和君权交叉的情况。
最后说一下君权。太平天国的君权实在小得可怜，它首先要受到神权的制约。因为天父下凡可以指挥一切，从国家大事一直到君主本人的私生活。其次又要受到兵权和相权的侵犯，实权已被剥夺殆尽，仅仅是一个虚名而已。从这种意义上来说，洪秀全确实是一位货真价实的“虚君”。
从神权、君权、相权和兵权这四大权力的分配来说，洪秀全和杨秀清二人交叉的情况是：杨秀清掌握了神权、君权的实权和兵权、相权的全部;而洪秀全只保留了神权和君权的虚位。从洪秀全和杨秀清二人之间的关系来说，也存在着复杂的交叉。
从政治上来说，洪秀全是君，杨秀清是臣，二人是君臣关系;从宗教上来说，洪秀全是二兄，杨秀清是四弟，二人是兄弟关系;在天父下凡的奇迹出现之时，杨秀清又代天父立言，洪秀全就成了跪地听旨的儿子了，二者又成了“父子”关系。这样形同儿戏的荒唐的复杂交叉关系，如果不是历史上真正发生过的，很难令人相信。而太平天国内讧的大悲剧，与这种复杂的交叉关系是脱不了干系的。
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