海军本部的势力在顶上战争之前似乎是称霸了伟大航路前半段，顶上战争之后稍显颓势，给人一种“海军是不是要完啊？”的感觉。不过就算海军在伟大航路后半段没有那么强的统治力，它依然是海贼王第一大势力，来看看它的构成就知道了。
1.海军将领
海军本部经历了一部分高层人员的流失后，现在还保留着相当一部分强力将领，最高级别的是元帅赤犬，在其之下是三大将黄猿、藤虎、绿牛，另外还有卡普、战国这两个实力不次于大将的老前辈，还有鹤中将这样的智囊。
这个数量的顶尖强者，让海军本部不害怕任何一个单独势力的挑战，就算是四皇级的白胡子带领全部兵力攻打海军本部，海军还是靠着杰出的个人能力挡住了。
2.七武海
除了海军将领，七武海也是受海军聘用的高手。通过卡普说过的话我们可以知道，七武海就是海军本部拉拢来对付四皇的，海军自己可能不惧怕一个四皇，但是要压制四个四皇，就要有更多的高手。
七武海就在这种情况下被招募，虽然并非每个七武海都对海军忠诚，不过为了保住海军赐予他们的某些特权，在海军需要的时候他们还是会出手相助，这已经足够让海军的底气变得更足。
3.秘密组织
海军本部还控制着不少秘密组织，比如CP1-CP8，这些间谍部门为海军提供各类情报，以及执行一些不太困难的黑暗任务。
标签CP9和CP0这两个机关分别是世界政府直属的暗杀组织和谍报组织，直接对天龙人和世界政府负责，海军不一定能指挥他们，但他们跟海军本部是同一立场的盟友，应该会提供帮助。
4.科技部队
海军抓到贝加庞克并收为己用，真的是捡到宝了。贝加庞克一个人的科研能力比海军整个科研部门都要强大，在贝加庞克的帮助下海军科技突飞猛进。
最大的进步就是拥有了科技部队——一支由和平主义者组成的特种部队，不会反抗、不会思考，忠实执行命令的恐怖军团。
5.屠魔令
海军中将以下的将领和士兵并非无用之人，屠魔令就是他们的舞台，根据海军本部或世界政府的要求，屠魔令可以出现在大海任何一个角落，对任何一个地点发动攻击。
屠魔令过后，被攻击的地点就会被从地图上抹去，可以说是大杀器了。这种攻击对于强者没用，对于实力不够强的海贼团或者其他人是很大的威慑力。
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