肯尼迪刺杀案解密档案文件被公开以后，一个接一个秘密公诸于世。肯尼迪刺杀案的背后还隐藏着两宗刺杀案：卡斯特罗和马丁路德金。
俄罗斯卫星通讯社11月10日报道，美国国家档案馆网站上公布的解密档案文件显示，美国中情局工作人员曾在肯尼迪总统遇刺之时向被招募的特工转交了一支有毒钢笔，以刺杀古巴领导人卡斯特罗。
这份注明日期为1967年的文件名为《关于策划刺杀卡斯特罗的报告》，共计130多页。文件作者指出，中情局工作人员于1963年11月22日美国总统肯尼迪遇刺之时在巴黎会见了古巴特工。除了有毒钢笔外，报告中还提到毒药片、毒雪茄和含有炸弹的海贝。而肯尼迪刺杀案似乎还有着更多不为人知的秘密。
美国CNN电视台4日报道，最新公布的肯尼迪刺杀案的文件中还包括了20份有关马丁·路德·金被刺死亡的文件。文件中，美国秘密警察试图让金的行动与共产主义者联系起来以便于定罪的内容被详细记录。另外，金领导的“南部基督教信徒会议”组织，存在资金来历不正当的问题也得到反映。再有，金被广泛流传的好色及生活作风混乱等问题，也有所记述，不过，这些内容被标注为属于推测。
《今日美国》10月29日报道，美国国家档案馆26日解禁了2891份前总统肯尼迪遇刺机密档案，令这一美国历史上“惊天谜案”的相关机密资料得以进一步公开。肯尼迪1963年11月22日在达拉斯（得克萨斯州）遇刺身亡。美国官方称，单独行动的凶手为前海军陆战队员奥斯瓦尔德。
