台媒称，针对复兴航空坠机事件，国家主席习近平2月4日指示"要求尽快准确掌握相关情况，积极协助开展伤员救治，做好家属安抚、善后处理等工作"。国务院总理李克强也作出批示，要求做好大陆乘客家属信息通报、安抚和善后等工作。此外，中共中央台办(国台办)也已派工作组赴台"抓紧开展相关工作"。
据台湾"中央社"2月4日报道，中共中央台办(国台办)获悉坠机事件后，立即启动应急机制，协调交通部民航局、国家旅游局和福建省、厦门市紧急处置，联系台湾有关方面了解事故情况，"并派工作组到台湾抓紧开展相关工作"。
国台办2月4日下午发布新闻稿指出，国台办与大陆海协会在复兴航空坠机事件发生后启动应急机制，透过台湾方面陆委会及海基会了解情况，"表达对机上乘客的关心和慰问，对遇难同胞的哀悼，并要求全力抢救包括大陆游客在内的两岸同胞"。
台湾方面海峡交流基金会副董事长周继祥表示，复兴航空班机坠河后他已致电大陆海峡两岸关系协会，对方说已在第一时间收到这项讯息，并向他求证。周继祥指出，海基会正在了解机上大陆观光团的伤者身份、居住地等资料。
