据台湾"中天新闻"报道，中国国民党主席马英九在12月3日下午举行的国民党中常会上，已经正式辞去党主席一职。另据台湾《中国时报》消息，马英九表示，每一张选票代表选民对台湾土地的爱，这次选举结果提醒国民党，掌握权力就必须要谦卑、倾听。
这次选举，国民党遭遇到前所未有的挫败，身为党主席，他要向所有支持者道歉，"我有负于创党的先烈先贤，我很惭愧，我让大家失望了!"他必须深刻反躬自省，也责无旁贷，必须为败选负起最大的责任。
马英九鞠躬致歉长达10秒。他脸色凝重地说，这败选告诉国民党，改革脚步还不够快，没有符合民众期待，也许他做的不够好，但从来不是为了个人，而是为了党、"国家"与民众。为了让台湾更好，让我们记住人民对我们最严厉鞭策的时刻，记取这次惨痛的教训，在最艰难的此时，展现国民党百年政党的意志，努力让国民党重新赢回人民的心，现在没有怀忧丧志、自乱阵脚的本钱!
马英九表示，希望代理党主席能尽快完成党主席补选工作，新任党主席要带领党员们继续团结合作、重新振作，让民众再给国民党一次机会。马并强调，他来自于一个国民党的家庭，全家人都是党员，深受党栽培，他以《总理纪念歌》歌词，"莫散了团结、休灰了志气，大家要相互努力"，
