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常规研究套路升华之换个角度看问题

2018-07-11 03:41    

上次荷叶介绍了给常规研究套路加个“高大上”的理论假说来升华文章的档次,但是很多时候没有这种理论假说怎么办呢?今天荷叶借一篇研究肿瘤内T细胞的文章一窥其研究套路的升华。

文章梗概:肿瘤抗原特异的CD8+T细胞是杀伤肿瘤的主力细胞群,但是肿瘤中的CD8+T细胞常常“发挥失常”。

Ying Zhang等通过研究了在肿瘤微环境中黑色素瘤抗原特异的CD8+T细胞的变化,发现在低氧、低糖的肿瘤微环境中CD8+T细胞利用脂肪酸分解代谢供能,维持CD8+T细胞杀伤能力;同时他们还发现促进脂肪酸代谢的PPAR激动剂能够与PD-1抗体相互协同抑制肿瘤生长。研究成果发表在2017年9月的《Cancer Cell》上。

常规研究套路

第一步,获得肿瘤抗原特异的TILs。

1)以黑色素瘤细胞系B16BrafV600E皮下荷瘤3天后,利用腺病毒系统表达黑色素瘤特异的抗原表位MAA(Trp-1455-463)和E7免疫小鼠;

2)利用OT-1转基因小鼠(表达OVA抗原表位),皮下接种B16OVA(表达OVA的B16细胞)。研究发现以肿瘤疫苗免疫的小鼠肿瘤生长缓慢。

第二步,观察、检测随着肿瘤进展肿瘤特异CD8+TILs的变化。作者从细胞数目、功能和形态等方面展开研究。

研究发现随着肿瘤进展,CD8+TILs细胞数目逐渐减少,同时PD-1和LAG-3免疫检查点表达水平逐渐升高。对CD8+TIL的功能研究发现,其颗粒酶GrmB、IFNr和穿孔素Perforin表达水平下降。

作者进一步研究发现随着肿瘤进展CD8+TILs的线粒体膜电位降低,而线粒体ROS升高。透射电镜观察了线粒体的超微结构,发现肿瘤生长时间长的CD8+TILs的线粒体肿胀,线粒体嵴减少,这些结果提示TILs的线粒体随着荷瘤时间的延长而发生改变。

第三步,探讨在肿瘤微环境中CD8+TILs发生这些变化的原因。由于肿瘤细胞的快速增殖能力,消耗大量的氧气和葡萄糖(有氧糖酵解),因此肿瘤微环境常常是低氧、低糖的。研究发现TILs细胞HIF1α表达水平随肿瘤进展而升高,HIF1α下游分子Glut1表达亦升高,这些提示TILs随着肿瘤进展而逐渐缺氧。进一步分析血清、荷瘤14天和30天的肿瘤组织的血糖水平,发现随着肿瘤进展肿瘤内血糖逐渐降低。

为了明确HIF1α在TILs和肿瘤中的作用,作者敲低CD8+T细胞的HIF1α的表达,发现敲低HIF1α后T细胞的杀伤能力增强。T细胞过继实验在体内证实敲低HIF1α能够抑制肿瘤的生长。

研究套路之升华

很可能大多数的研究者研究到这就接近尾声了,有表型,有机制,还做了体内的挽救实验,发个7-8分的文章还是不成问题的。但是这篇文章的作者没有浅尝辄止。

第四步,作者没有局限于HIF1α,而是将HIF1α作为一个引子,换了个研究角度,从代谢的层面出发,继续深入研究低氧、低糖的肿瘤微环境中CD8+TILs发生变化的原因。作者发现敲低HIF1α后TILs的代谢发生改变:糖酵解相关酶表达下降,脂肪酸代谢相关酶升高。

作者转换研究角度,分析了CD8+T细胞低糖、低氧环境的代谢表达谱,发现葡萄糖摄取、糖酵解相关基因表达下降,而脂肪酸摄取、脂肪酸代谢相关基因表达升高。

通过同位素标记跟踪13C的去向,作者在肿瘤模型的TILs中验证表达谱实验的结果,CD8+TILs随着肿瘤进展逐渐由脂肪酸分解代谢供能。同时对人肿瘤样本的研究发现,黑色素瘤转移灶内脂肪酸的含量增高,进一步提示脂肪酸分解代谢在肿瘤进展中的作用。

第五步,TILs的脂肪酸代谢特征如何影响肿瘤呢?作者通过PPARα的激活或抑制观察脂肪酸代谢对TILs功能的影响:发现PPARα激动剂fenofibrate能促进TILs向肿瘤组织的浸润,提高CD8+T细胞的杀伤能力,抑制黑色素瘤的生长。

而PPARα敲除后TILs的功能显著下降,GrmB、IFNr和Perforin表达水平明显下降。

第六步,研究了调节代谢药物与肿瘤免疫疗法相结合疗法的可行性。作者发现肿瘤微环境能够影响TILs免疫检查点的表达水平:HIF1α与LAG-3的表达呈正相关(可能与LAG-3启动子上有HIF1α的结合区有关),PPARα与PD-1的表达呈正相关。

抑制免疫检查点抗体与代谢药物联合作用效果如何呢?研究发现PD-1抗体治疗不影响TILs的脂肪酸代谢。但是PPARα激动剂fenofibrate能够协同PD-1抗体增强肿瘤治疗的效果。

综上所述,本研究发现在低糖、低氧的肿瘤微环境中CD8+TILs激活PPARα信号和脂肪酸的分解代谢,加速脂肪酸的分解代谢(燃烧脂肪)能够协同PD-1抗体增强肿瘤治疗效果。

科研狗们,你是否有这样的经历:当我们千辛万苦终于确认了一个表型,但是深入研究分子机制的时候常常力不从心,越做方向越窄,最终围绕着某个分子打转,尽管最终发了一篇paper,但是连你自己都不很自信,“我找的这个分子是主要机制吗?”如同本篇文章,大多数人很可能就会围绕HIF1α继续研究了,其创新性就不够。但是跳出这个窠臼,从更高层面研究——从HIF1α转到脂肪酸代谢,妥妥的高分文章。

苦恼于分子机制研究的科研狗们,不甘于发个低分文章的科研狗们,换个研究角度大胆的试一试吧!

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